Smernice za objavo podatkov o COVID-19
Naj bodo vaši podatki raziskave o COVID-19 uporabni in dostopni za preostalo raziskovalno skupnost z objavo v repozitoriju skupaj z metapodatki.
Repozitoriji
Predlagamo, da se surovi podatki o sekvencah virusa, pa tudi sestavljeni in označeni genomi oddajo v ENA. Pred oddajo si oglejte dokumentacijo o oddaji podatkov SARS-CoV-2. Pred oddajo surovih podatkov o zaporedju je potrebno odstraniti kontaminirane dele, ki so posledica odčitkov ljudi.
Metapodatki
Metapodatki so "podatke o podatkih" in vključujejo informacije o metodologiji, ki se uporablja za zbiranje podatkov, analitične in postopkovne informacije, definicije spremenljivk, merske enote, vse predpostavke, obliko in vrsto datoteke podatkov in programske opreme, ki se uporabljajo za zbiranje in / ali obdelavo podatkov. Raziskovalcem priporočamo, da uporabljajo standarde metapodatkov v skupnosti, kadar ti obstajajo.
MINSEQE (Minimal Information about a high throughput SEQuencing Experiment) je najprimernejši minimalni standard metapodatkov za podatke transkriptomike na splošno. Za virusne podatke razmislite o uporabi ENA standardnega kontrolnega seznama poročanja o povzročiteljih virusa.
Zelo priporočljivo je, da že od samega začetka projekta strukturirate metapodatke o vzorcih na način, ki omogoča pošiljanje podatkov genskih sekvenc, ne da bi bilo treba znova določiti metapodatke.